צאו בבדיקת ערכת הבדיקה וכלבי הדנה של כלבים

Embark, שנוסד על ידי אחים מדענים לאחר שנים של חקר גנטיקה של כלבים, כולל את המאגר הגדול ביותר של גזעי כלבים מסוגו. הוא בודק יותר מ -250 סוגים של גורים, כמו גם זאבים, זרעי זאב, דינגואים, ומה שנקרא חופשי "כלבי הכפר". רוחב ניתוח זה הוא המפתח בכל הקשור לדיוק של קביעת הגזע. התחל גם לבדוק את ה- DNA של חיית המחמד שלך אם יש סימנים של 165 מצבים רפואיים גנטיים, ויכול לקבוע אם הפופר שלך הוא נשא של סיכון ללקות במחלה מלאה או בסיכון. זה בדיקות מוטציה יותר מכל ערכת בדיקת DNA אחרת לכלבים. היציאה לדרך היא יקרה, ואולי מציעה יותר מדי מידע, אך אלה הליקויים היחידים בה.

שירותי סינון גנטי

Embark הוא ערכת ה- DNA היקרה ביותר לחיות מחמד שבדקתי, והיא מוצעת רק בערכת בדיקה אחת. בזמן כתיבת שורות אלה, אתה יכול לקבל מחיר טוב יותר אם אתה בוחן מספר כלבים (השתמש בקוד הקופון "MULTIPACK" באתר של Embark), עם הנחה מקסימאלית של 20 אחוזים בארבע ערכות או יותר. מקלטים, מגדלים וטרינרים יכולים גם לקבל הנחות. אך כפי שנאמר, אתה מקבל את מה שאתה משלם עליו. ההצהרה באתר Embark טוענת שתהליך זיהוי הגזע שלה "בודק מעל 200, 000 סמנים גנטיים ובונה את תערובת הגזע של הכלב שלך כרומוזום על ידי כרומוזום."

במהלך תהליך ההרשמה, שעליך לבצע לפני שתשלח את הדגימה, המבקש מבקש ממך אישור להשתמש במדגם שלך למחקר. אמברק שותף למכללה לרפואה וטרינרית באוניברסיטת קורנל - זה עוזר למייסד המשותף, אדם בויקו, הוא פרופסור שם - ולכן החוקרים חשובים לנתוני אמברק. החברה תעבוד גם עם חוקרים חיצוניים המשתמשים במידע על בדיקות ה- DNA, כמו השותפים הנוכחיים VetGenomics ו- Doberman Diversity Project.

אוסף DNA

האריזה של Embark בולטת בתחרות. לדוגמה, אני אוהב את ההוראות המאויירות והברורות של הערכה. כרטיס שבתוכו מציג את כל ההוראות, ובנוסף הוא מפרט את כתובות האתרים בהן תוכלו לבקר כדי להפעיל את הערכה, עיין ברשימות גזע, ללמוד כיצד לסחוב את לחיו של כלב כדי להשיג דגימה ועוד.

יש בחבילה גם תג כלב פלדה "בדרגת טילים", עם כתובת URL מאחור. אם הכלב שלך הולך לאיבוד, מי שיגלה שהוא יכול להשתמש בכתובת האתר כדי לגשת לנתונים משותפים על הכלב. אם אדם זה יתקשר למספר הטלפון שבתגית, Embark ישמש כצד שלישי כדי לזווג את האיתור ואת הבעלים. במילים אחרות, התחל לא רק למסור את פרטי הקשר האישיים שלך.

הדבר הראשון שאתה עושה, כמובן, הוא להפעיל את הערכה - ממש כמו עם ערכות DNA אנושיות. יש לך אפשרות להשתמש בכניסות של פייסבוק או גוגל, או ליצור חשבון עם כתובת הדוא"ל שלך. אם יש לך ערכות מרובות לכלבים מרובים, רשום את כל הערכות לאותו חשבון לגישה מקוונת קלה. ברגע שחשבונך פעיל, צור פרופיל כלבים לכל ערכה שתרצה להפעיל ורשום כל אחד מהם עם המספרים מתוך ערכת Embark.

כאן תוכלו גם להחליט אם אתם רוצים שהנתונים של הכלב שלכם יתרמו למחקר רפואי ומדעי (עוד על כך בהמשך.) Embark מודיע לכם שהוא ישלח עדכונים במייל, ואם תרצו ויהיו בארה"ב, SMS הודעה.

האזהרות על גבי האריזה מורות לך לא לרסק את הקופסה, מכיוון שהיא משמשת כמכולה למשלוח חזרה עבור דגימת ה- DNA. זו בדיקת ה- DNA היחידה שראיתי שדורשת ספוגית אחת - השאר דורשים שתי דגימות. ספוג האיסוף של Embark מגיע על קצה מיכל פלסטיק מלא בנוזל מייצב. ספגו את כיס כיס הלחי התחתון של הכלב (בין חניכיים ללחי, רצוי בלעדיהם ללעוס אותו) למשך 30 שניות - זה 10 שניות יותר מהמתחרים. נתקו את היחידה, הפכו אותה והניחו את הספוג בנוזל. נענע אותו בעדינות למשך 10 שניות והדגימה מוכנה להיכנס לדואר. Embark ככל הנראה משתמש בדגימה מחברה בשם DNAGenotek; להלן סרטון ההוראות המשמש באתר של Embark:

בדיקות ספוגיות ה- DNA מהתחרות כוללות פשוט לזרוק מעט ספוגיות כותנה ארוכות במעטפה. המבחן של Embark מרגיש יותר היי-טק ואמין, גם אם אין דרך להיות בטוחים. זו אותה שיטה בה נבדק בדיקת ה- DNA האנושית MyHeritage DNA. אחרי הכל, אי אפשר באמת לגרום לכלבים לירוק לתוך צינור, כמו שבני אדם עושים עם 23andMe.

עקוב אחר ההוראות להכניס את הדגימה למעטפת הפלסטיק הכלולה, טפח על הכל לאותה קופסה שנכנסה בה וסגור את הדש. קפץ אותו לדואר. שלי הלך למעבדה של אמברק במטה שלה בבוסטון. כל המשלוח בתשלום מראש.

ההערכה לקבל את התגובה מ- Embark היא שבועיים עד ארבעה שבועות. קיבלתי תשובה בערכה אחת תוך 19 יום; הדגימה השנייה הופיעה עם תוצאות הגזע ב 21 יום (עם יום נוסף להמשך המידע יופיע). זהו זמן תפנית מצוין.

דוחות DNA ותכונות נוספות

Embark מקיים דוח לדוגמא באופן מקוון, הכולל את הכלב "הפוטוגני" המגוחך של המנכ"ל, הארלי. (הכלב אכן פוטוגני.) ברגע שנשלח הדגימה שלך, Embark מודיע לך באמצעות הדוא"ל לאורך כל התהליך. קיבלתי דוא"ל לפיו הערכה הייתה בדרך פחות משלוש שעות לאחר שהפקתי אותה בסניף הדואר. הודעו לי על הגעת הדגימה למעבדה, תחילת הגנוטיפ, כאשר גנומיקאים (מדען המתמחים בגנום) יבדקו את המדגם, ולבסוף הודעת דוא"ל לפיה התוצאות היו. קיבלתי גם את הסרט המטורף הזה. אלפא מכיוון ש- Embark עוסק בזה. לעתים נדרשות תוצאות בריאותיות יותר מאשר תוצאות גזע.

בניגוד לבדיקות ה- DNA האחרות שעשינו, Embark מכניס הרבה תוצאות לתא-מייל הסופי ההוא, כולל תרשים סופגניות קטן עם תוצאות גזע ראשוניות, ואפילו רמז קטן לכמה DNA של זאב נמצא בכלבלב הביתה הטהור שלך. לקבלת התוצאות המלאות, אתה נכנס דרך אתר ה- Embark שלי. שם תוכלו גם להדפיס דוחות PDF, אם כי לא כל הנתונים המקוונים מופיעים ב- PDF.

המתודולוגיה שלי הייתה לבדוק פעם אחת כלב מגזע טהור (גריפין) ולבדוק אם חברת הבדיקות תשיג את הגזע, ואז לבדוק את בן זוגי הזן מעורב (מדיסון) פעמיים - פעם בשם שגוי ("דייזי") חשבון חדש - כדי לראות אם התוצאות היו זהות בשתי הפעמים. בהתחשב בבדיקות שהועברו על ידי Embark לשימושים שלנו, יתכן שזה יכול פשוט לעקוב אחר מספרי הדגימה שהיא שלחה ל- PCMag ולפקח על תחבולות כאלה, אבל זה נראה כמו עבודה רבה.

התוצאות

התחנה הראשונה שכנראה תרצה לבצע בתוצאות המלאות היא כפתור הגזע. אני שמח לדווח כי Embark חשב שגריפין הוא גולדן רטריבר בשיעור של 100.0 אחוז, וזה מסכים עם כמה בדיקות DNA אחרות, בתוספת הבעלים והגדל של גריפין.

מדיסון, כמובן, חזר עם תערובת של גזעים מכל מקום: 34.2 אחוז פיטבול טרייר אמריקני, 17.5 אחוז כלב רועים שטלנד, 13 אחוז לברדור, 12.4 אחוז ספרינגר ספניאל האנגלי, 9.1 אחוז בול טרייר, 7.1 אחוז גרמני שפרד דוג (GSD), ו -6.7 אחוז רוטוויילר. אף בדיקת DNA אחרת לא איבדה אותה כמי שיש לה ספרינגר או GSD בגנים שלה.

מה קרה במבחן השני של מדיסון (המכונה גם "חיננית")? כל אותם גזעים היו שם, אחוזים מעט שונים יחסית לאלה שבאמצע.

מעניין שהגזע הבולט של Embark עבור מדיסון הוא פיטבול טרייר ולא האמריקני סטפורדשייר טרייר - שניהם בדרך כלל מתגבשים זה לזה תחת המוניקר "פיטבול", אבל יש הבדל, לפחות בגודל ובמראה שלו. טרייר סטפורדשייר האמריקני היה הבחירה המובילה ביותר במדיסון על ידי בדיקות DNA אחרות, כמו פאנל החוכמה.

קטע הגזע מספק מידע נוסף על משפחות הגזע שמתאפרות לכלב, ובנוסף מעניק מבט על ההפלוטייפ (רצף ה- DNA) לאמו ולאביו של הכלב, ואפילו מראה מפות היכן שאולי אבותיו הקדומים של הכלב מקורם. אלה דברים של מה בכך, וחלקם (כמו המפות) מרגישים כמו מילוי.

אילנות היוחסין של מדיסון ו"דייזי "היו זהים. בדיקות מ- DNAfirm ו- DNA My Dog לא הצליחו להיות עקביים אפילו עם עצמם, והטילו שום אמונה בהן בספק. לא כך עם היציאה מהדרך. נוף אילן היוחסין פורץ את הורות הגזע. שים לב שגריפין אפילו לא הרוויח עץ, וזה בסדר, כמו שיהיה כל גולדנס.

בריאות ועוד

עיון בקטע הגזע שנמצא תחת כניסת הכלב שלך הוא רק ההתחלה. מדור המחקר דורש ממך, בעל הכלב, עבודה - זה מיועד לאלו שמתכננים לתרום את ה- DNA של הכלב שלהם למדע. צא לדרך מקווה שתמלא מספר סקרים קטנים בכדי שהתרומה הזו תהיה כדאית, בנושאים כמו בריאות השיניים של הכלב שלך, בעיות התנהגות ואלרגיות, וסקר רפואי מלא. זה כיף בדיוק כמו שהייתם מצפים: אף אחד. עם זאת, עשה זאת אם אתה רוצה להרוויח את החוויה המלאה של שיפור העולם באמצעות הגנום של הכלב שלך.

ככל הנראה, החלק הבריאותי הוא החשוב ביותר, מכיוון שיש לו את התוצאות עבור כל הבדיקות שבוצעו לצורך מוטציות גנטיות שכלבך יכול היה לבצע, או לפחות לבצע. תוצאותיו של גריפין היו ברורות לחלוטין, שהסכימו עם ממצאי פאנל החוכמה. גם תוצאותיה של מדיסון הסכימו - היא נשאת למיאלופתיה ניוונית, אך לא תעביר אותה מאז שהיא עוקרת. אפילו כשהוא ברור, חלק זה ממשיך להציג תנאים שכיחים לגזע (ים) של הכלב. רוב המידע הזה יעניין רק אנשים שיש להם כלב בסיכון, אך האפשרות היא לקרוא על כל 165.

שים לב כי הדו"ח של מדיסון מציג תוצאות עבור 162 סה"כ בדיקות בלבד, ולא 165 שפורסמו. נציג החברה אמר, "אם האלגוריתמים שלנו לא בטוחים במאה אחוז לשיחת בריאות היא לא תקרא לזה." אם יש מבחן ספציפי שלקוח רוצה תוצאות עליו והם לא רואים זאת, אל תניח שהוא שלילי. היציאה לסקירה תבדוק תוצאה ידנית לפי בקשת בעל הכלב.

ישנם קישורים במדור הבריאות ליצירת דוח קל לשיתוף או הדפסה עבור וטרינרים. אם הכלב הוא מטורף, יש גם קישור לשליחת דוח על הממצאים הגנטיים לקרן האורטופדית לבעלי חיים (OFA), ארגון שרוצה להפחית מחלות גנטיות בבעלי חיים נלווים.

לבסוף, יש קטע מתקדם המציג תוצאות שרק גנטיקאי יבין. זה מפרק מידע כמו כמות של DNA מגזע שנמצא על כל אחד מ -38 הכרומוזומים, והכל במערך גרפים צבעוני. גלול מטה למידע על המגוון הגנטי של הכלב, המספק מדד בפועל לגידול (עד כמה קשורים ההורים של הכלב). ככל שגידול רב יותר, כך יכולים לקרות תנאים בירושה גנטית יותר. להוריו של מדיסון האם היה מקדם גידול של 0 אחוז; אך הוריה של גריפין הזעירים היו 23 אחוזים משיעור הגנים זהים בשני ההורים.

אם אתה משגע בקריאת גנומים, Embark מאפשר לך להוריד קבצי ZIP עם כ -7 מגה-בייט של נתונים לא-פרשניים של 200, 000 הסמנים שבדגימות. מה שתעשה עם זה הניחוש של מישהו.

דוח התכונות מעט מעניין, ומראה את המיקומים הגנטיים שמשפיעים על צבעים ומעילים. זה שוב עמוס בדיבורים על כרומוזומים וקישורים לכלבים אחרים שמטיילים עם ממצאים דומים. היוצא מן הכלל הוא הקטע מקדם ריבוי, המראה עד כמה אימא ואבא של כלב טהור חולקים את אותם גנים. הוריה של גריפין קיבלו תוצאה של 23 אחוזים (האנשים של מדיסון האומל: 0 אחוז). היה מעניין לראות ש"דייזי "מופיעה כבעלי אותו גנוטיפ כמו מדיסון. אך בטווח הרחוק, קטע התכונות המפוכחות של Wisdom Panel טוב יותר למשתמש הממוצע מאשר הנתונים המסובכים יותר של Embark.

מסקנות גנטיות

היציאה לדרך היא העסקה האמיתית. אם אתה עוסק בעיקר בסוגיות הבריאות הגנטיות הפוטנציאליות של הכלב שלך, ערכה זו צריכה להיות הבחירה הראשונה שלך; זה פשוט בודק בעיות נוספות. לשם כך בלבד, שווה 50 דולר נוספים על מחיר לוח החוכמה. בתוצאות שלנו, קביעת הגזע עקבית ברובה. עם הרקע המדעי שיש לחברה, אין סיבה קטנה להרגיש פחות בטוחים בתוצאתה. עם זאת, חלק גדול מהנתונים המוצגים מיותרים ומסובכים עבור בעל הכלבים הממוצע.